«Матрица» (которая в одноименном фильме) — это, фактически, очень большой компьютер. Или скорее сеть — весь мир необязательно обсчитывать в одном «ящике», дешевле разложить это на некий кластер. Матрица имеет правила — являющиеся «законами природы» нашего мира.
Поскольку это для нас это законы, а для матрицы — это правила, «законы природы» можно обойти, можно нарушить, можно изменить. Либо имея соответсвующий доступ («агенты»), либо… либо найдя «дыру» в программах матрицы (возможность получить доступ выше положенного), или создав «черный ход» (перед этим как-то получив возможность его создать).
Многие участники «движения сопротивления» умели в той или иной мере «обходить» законы физики, а «черные ходы» активно использовались для выхода из матрицы в «реальный мир». Админы матрицы, видимо, не рассматривали это слишком всерьез — во всяком случае, о патчах матрицы в фильме не упоминалось.
Хотя черные ходы регулярно уничтожались, а хакеры… пардон — участники сопротивления отлавливались и уничтожались, в том числе физически (атака все-таки шла не совсем изнутри).
В фильме всё закончилось хорошо — все «наши» выжили, а Нео получил административный доступ к матрице, покилял учетные записи адми… агентов, и начал оттягиваться по полной.